У вересні 1960 року було покладено початок організації зоопарку в Душанбе - столиці Таджикистану. Відкриття цього зоопарку, первістка в республіці, відбулося в квітні 1961 року. Але це не був ще зоопарк в широкому розумінні, а лише зоовыставка, що розміщувалося на площі 1,5 га, де демонструвалося в клітинах 121 тварина 41 виду. Виставка привернула увагу. З дня відкриття і до кінця першого року її існування відвідуваність склала 75 тисяч осіб.
Враховуючи інтерес, проявлений до виставки, і з метою якнайшвидшого виконання відповідних рішень про організацію зоопарку міськвиконком Душанбе розширила земельну ділянку, займаний виставкою, до 8 гектарів. Одночасно були виділені кошти для благоустрою території та будівництва нових фундаментальних об'єктів для утримання тварин для господарських потреб. Всього було побудовано близько 20 експозиційних і господарських об'єктів загальною площею понад 5000 квадратних метрів.Створені були також 4 штучних ставка для утримання водоплавних птахів загальною площею 15000 квадратних метрів. Зоовыставка перетворилася в зоопарк, збільшилася його відвідуваність, і в 1966 році до займаної площі був приєднаний прилеглу земельну ділянку площею 7 гектарів. У результаті площа зоопарку збільшилася до 15 гектарів, з яких повністю освоєні під експозицію і зону відпочинку відвідувачів 12 гектарів, а 3 гектари залишаються резервними.
На 1 січня 1980 року колекція тварин склала: риб - 750 примірників 73 видів, земноводних - 17 примірників 5 видів, плазунів - 110 примірників 38 видів, птахів - 815 примірників 142 видів і ссавців - 325 примірників 114 видів. Серед тварин рідкісні види, занесені до «Червоної книги СРСР»: бухарські олені, антилопи козли, джейрани, кулани, снігові барси та інші. З числа рідкісних тварин зарубіжної фауни белобородые гну, вінценосні голуби.
Відвідуваність зоопарку досягає 560 тисяч чоловік в рік.
